PAVS: A Standardized Database of Phenotype-Associated Variants from Saudi Arabian Rare Disease Patients
サウジアラビアの希少疾患患者に特化したゲノム・表現型データベース「PAVS」が開発され、多様なコホートと文献データを統合して表現型に基づく遺伝子優先順位付けの精度を向上させ、過小評価された集団における変異解釈のギャップを埋めることが示されました。
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genetic and genomic medicine
126 件の論文
遺伝子とゲノム医学は、私たちの体の設計図であるDNAを読み解き、病気の原因や治療法を探る最先端の分野です。この領域では、個人に合わせた医療や新たな薬の開発が急速に進んでおり、未来の健康管理の形を大きく変えようとしています。
Gist.Scienceでは、medRxivから投稿されるこの分野のすべての最新プレプリントを扱っています。専門的な論文を誰にでもわかる平易な言葉で要約すると同時に、研究者向けの技術的な詳細も併せて提供し、科学的な知見へのアクセスを democratize することを目指しています。
以下に、medRxivから最新に追加された遺伝子およびゲノム医学に関する研究論文の一覧を掲載します。
Genomic ascertainment of PALB2-related cancer predisposition
この研究は、大規模なコホートを用いたゲノムスクリーニングにより、PALB2 遺伝子変異保有者が乳がんや膵がんなど複数のがんリスクおよび死亡率の上昇を示すことを明らかにしたが、そのリスクは家系由来の集団で見られる推定値よりも低いことを示しました。
Functionality-Informed Fine-Mapping Dissects Common Variant Contributions to Coronary Artery Disease and Identifies Causal Variants and Pathways
この論文は、100 万人以上の欧州系個人からの GWAS 要約統計量を用いた機能情報に基づくベイズ型精细マッピング（SBayesRC）により、冠状動脈疾患の遺伝的リスクが脂蛋白機能、血管恒常性、細胞ストレス応答および炎症という 3 つの生物学的プロセスの乱れによって駆動されていることを明らかにし、PHACTR1、APOE、LPL などの因果変異を同定したことを報告しています。
Sex-specific dissection of adiposity genetics reveals distinct pathways to endometrial cancer risk
200 万人のデータを用いた性特異的な肥満遺伝子解析により、肥満が子宮内膜癌のリスクに及ぼす影響の大部分が女性に特異的な遺伝的経路（ホルモン応答やインスリン・レプチンシグナルなど）を介して媒介され、そのメカニズムが解明されたことを明らかにした。
Assessing the clinical significance of a novel rare variant in Loeys-Dietz Syndrome by combining AI-driven modelling and cell biology
本研究では、AI を用いた分子モデリングと細胞実験を組み合わせることで、Loeys-Dietz 症候群患者に見出された新規変異 E431K が TGFBR2 機能に悪影響を及ぼし、同症候群の診断を確立したことを明らかにしました。
The Power of Partnership: Democratizing Genetic Prevalence to Empower Patient Advocacy
患者団体との連携により遺伝的有病率を推定するツール「GeniE」を開発し、ゲノムデータベースの更新に伴う推定値の変動を明らかにすることで、希少疾患の患者支援や創薬を促進する透明性のあるデータ基盤の構築を提案しています。
Genome-Wide Variations of End Motif in Cell-Free DNA Fragments Distinguish Immunotherapy Responders from Non-Responders in Head and Neck Cancer: A Multi-Institute Prospective Study
この研究は、頭頸部扁平上皮癌の免疫療法反応性を予測する新たなバイオマーカーとして、細胞フリー DNA の断片化パターン（5'末端モチーフ）の多様性を定量化する「rMDS」スコアを開発し、その臨床的有用性を多施設前向き試験で実証したものである。
FRMPD4, a causal gene for intellectual disability and epilepsy, is associated with X-linked non-syndromic hearing loss
FRMPD4 遺伝子変異が、これまで知られていた知的障害やてんかんに加え、非症候性難聴の原因遺伝子としても機能し、その聴覚機能における進化的に保存された役割を複数のモデル生物による解析で実証した。
Genetic influence of BCAA metabolism on type 2 diabetes and coronary artery disease, independent of traditional risk factors
この研究は、大規模ゲノム解析を用いて、肥満や脂質異常などの従来のリスク因子とは独立して、分枝鎖アミノ酸代謝が遺伝的に2 型糖尿病および冠動脈疾患の発症に関与していることを初めて明らかにしました。
Diagnostic Accuracy of Large Language Models for Rare Diseases: A Systematic Review and Meta-Analysis
このシステマティックレビューとメタアナリシスは、希少疾患の診断における大規模言語モデルの性能が評価ベンチマークの疾患構成や知識拡張の有無によって大きく変動し、すべての研究に高いバイアスリスクが存在するため、臨床導入には独立した前向き研究と標準化された評価基準が不可欠であると結論付けています。